Reference frame: Origins (Ox, Oy, Oz) followed by the direction cosines of the X- (Xx, Yx, Zx), Y- (Yx, Yx, Yx), and Z- (Zx, Zx, Zx) axes ***************************************************************************************** Local base-pair reference frames Ox Oy Oz Xx Xy Xz Yx Yy Yz Zx Zy Zz 1 G-C 0.27 32.94 2.70 0.19 -0.94 0.30 0.70 0.34 0.63 -0.69 0.09 0.72 2 A-T -1.30 33.70 5.02 0.67 -0.60 0.42 0.47 0.79 0.38 -0.57 -0.06 0.82 3 G-C -2.43 33.56 8.29 0.82 -0.05 0.57 -0.01 1.00 0.09 -0.57 -0.08 0.82 4 C-G -3.90 33.15 11.31 0.61 0.59 0.52 -0.55 0.80 -0.26 -0.57 -0.13 0.81 5 A-T -5.77 34.29 14.68 0.13 0.97 0.20 -0.86 0.21 -0.46 -0.49 -0.11 0.86 6 T-A -6.62 34.22 17.09 -0.15 0.97 -0.20 -0.87 -0.22 -0.45 -0.48 0.10 0.87 7 G-C -8.56 33.12 20.65 -0.62 0.58 -0.53 -0.55 -0.80 -0.24 -0.56 0.14 0.82 8 C-G -10.26 33.78 23.63 -0.81 -0.06 -0.59 0.01 -1.00 0.09 -0.59 0.07 0.80 9 T-A -11.33 34.19 26.90 -0.69 -0.61 -0.38 0.51 -0.79 0.34 -0.51 0.04 0.86 10 C-G -12.90 33.69 29.49 -0.21 -0.98 -0.07 0.81 -0.21 0.55 -0.55 0.05 0.83 11 A-T -13.91 33.72 32.63 0.28 -0.95 0.13 0.76 0.31 0.58 -0.59 -0.06 0.81 ***************************************************************************************** Local middle reference frames Ox Oy Oz Xx Xy Xz Yx Yy Yz Zx Zy Zz 1 GA/TC -0.51 33.32 3.86 0.45 -0.81 0.39 0.63 0.59 0.50 -0.63 0.02 0.77 2 AG/CT -1.86 33.63 6.66 0.78 -0.34 0.52 0.24 0.94 0.25 -0.57 -0.07 0.82 3 GC/GC -3.17 33.36 9.80 0.77 0.29 0.57 -0.30 0.95 -0.09 -0.57 -0.10 0.82 4 CA/TG -4.83 33.72 12.99 0.40 0.83 0.38 -0.75 0.54 -0.39 -0.53 -0.12 0.84 5 AT/AT -6.19 34.25 15.88 -0.01 1.00 0.00 -0.87 -0.01 -0.49 -0.49 -0.01 0.87 6 TG/CA -7.59 33.67 18.87 -0.42 0.83 -0.37 -0.75 -0.55 -0.38 -0.52 0.12 0.85 7 GC/GC -9.41 33.45 22.14 -0.76 0.28 -0.58 -0.29 -0.95 -0.08 -0.58 0.10 0.81 8 CT/AG -10.80 33.99 25.26 -0.79 -0.35 -0.50 0.27 -0.93 0.24 -0.55 0.05 0.83 9 TC/GA -12.11 33.94 28.19 -0.47 -0.85 -0.25 0.70 -0.53 0.47 -0.53 0.05 0.85 10 CA/TG -13.40 33.70 31.06 0.04 -1.00 0.03 0.82 0.05 0.57 -0.57 -0.00 0.82 ***************************************************************************************** Local middle helical reference frames Ox Oy Oz Xx Xy Xz Yx Yy Yz Zx Zy Zz 1 GA/TC -0.57 32.66 4.04 0.42 -0.80 0.44 0.81 0.54 0.21 -0.41 0.27 0.87 2 AG/CT -2.08 34.93 6.64 0.80 -0.34 0.49 0.24 0.94 0.24 -0.54 -0.08 0.84 3 GC/GC -3.10 33.76 9.88 0.80 0.30 0.52 -0.31 0.95 -0.07 -0.51 -0.10 0.85 4 CA/TG -6.10 34.11 12.16 0.46 0.84 0.30 -0.70 0.54 -0.46 -0.55 0.00 0.84 5 AT/AT -5.97 37.19 16.04 0.02 1.00 -0.03 -0.58 -0.01 -0.82 -0.82 0.03 0.57 6 TG/CA -6.46 34.21 19.65 -0.47 0.83 -0.30 -0.68 -0.55 -0.48 -0.56 -0.02 0.83 7 GC/GC -9.97 33.45 21.82 -0.82 0.29 -0.49 -0.28 -0.96 -0.10 -0.49 0.06 0.87 8 CT/AG -10.25 35.18 25.29 -0.84 -0.34 -0.42 0.19 -0.92 0.35 -0.51 0.21 0.84 9 TC/GA -11.61 34.09 28.52 -0.44 -0.85 -0.31 0.72 -0.53 0.45 -0.55 -0.02 0.84 10 CA/TG -13.93 34.16 30.89 0.09 -0.99 -0.06 0.92 0.06 0.38 -0.38 -0.09 0.92 ***************************************************************************************** Local strand I base reference frames Ox Oy Oz Xx Xy Xz Yx Yy Yz Zx Zy Zz 1 G 0.23 32.99 2.68 0.12 -0.93 0.35 0.73 0.32 0.60 -0.67 0.18 0.72 2 A -1.39 33.60 5.06 0.58 -0.60 0.55 0.40 0.80 0.45 -0.71 -0.04 0.70 3 G -2.52 33.53 8.31 0.77 -0.05 0.64 -0.06 0.99 0.15 -0.63 -0.16 0.76 4 C -3.72 33.24 11.25 0.55 0.59 0.59 -0.59 0.77 -0.22 -0.59 -0.23 0.78 5 A -5.62 34.32 14.66 -0.05 0.99 0.15 -0.82 0.05 -0.58 -0.58 -0.15 0.80 6 T -6.47 34.18 17.02 -0.32 0.93 -0.18 -0.90 -0.36 -0.25 -0.30 0.08 0.95 7 G -8.39 33.08 20.62 -0.67 0.59 -0.45 -0.53 -0.80 -0.27 -0.52 0.06 0.85 8 C -10.40 33.79 23.74 -0.84 -0.07 -0.53 0.08 -1.00 0.01 -0.53 -0.04 0.85 9 T -11.47 34.27 27.09 -0.75 -0.60 -0.28 0.55 -0.80 0.24 -0.37 0.03 0.93 10 C -12.97 33.63 29.55 -0.25 -0.97 -0.02 0.82 -0.22 0.53 -0.52 0.12 0.85 11 A -13.85 33.67 32.53 0.25 -0.96 0.14 0.71 0.28 0.64 -0.66 -0.06 0.75 ***************************************************************************************** Local strand II base reference frames Ox Oy Oz Xx Xy Xz Yx Yy Yz Zx Zy Zz 1 C 0.31 32.90 2.72 0.25 -0.94 0.25 0.66 0.35 0.66 -0.70 -0.00 0.71 2 T -1.20 33.80 4.99 0.74 -0.61 0.29 0.53 0.79 0.30 -0.41 -0.07 0.91 3 C -2.34 33.59 8.27 0.86 -0.05 0.50 0.04 1.00 0.02 -0.50 0.00 0.86 4 G -4.08 33.07 11.36 0.67 0.58 0.45 -0.50 0.81 -0.30 -0.54 -0.03 0.84 5 T -5.91 34.25 14.69 0.32 0.92 0.21 -0.86 0.38 -0.34 -0.40 -0.07 0.91 6 A -6.78 34.26 17.16 0.01 0.99 -0.16 -0.77 -0.09 -0.63 -0.63 0.13 0.76 7 C -8.73 33.16 20.68 -0.57 0.57 -0.60 -0.57 -0.79 -0.22 -0.60 0.22 0.77 8 G -10.13 33.78 23.52 -0.76 -0.06 -0.64 -0.07 -0.98 0.16 -0.64 0.17 0.75 9 A -11.19 34.11 26.70 -0.62 -0.63 -0.47 0.46 -0.77 0.43 -0.63 0.05 0.77 10 G -12.82 33.75 29.43 -0.16 -0.98 -0.12 0.80 -0.20 0.57 -0.58 -0.01 0.81 11 T -13.97 33.76 32.73 0.32 -0.94 0.12 0.80 0.34 0.50 -0.51 -0.06 0.86 **************************************************************************** Local strand I base step parameters step Shift Slide Rise Tilt Roll Twist 1 G/A -0.04 0.64 2.87 9.79 9.13 33.51 2 A/G 1.20 0.70 3.15 4.36 7.25 33.59 3 G/C 0.95 0.03 3.05 4.81 1.59 39.69 4 C/A 1.82 0.41 3.59 -0.87 4.51 49.51 5 A/T -0.09 -0.29 2.49 19.98 10.09 23.09 6 T/G -0.94 1.04 3.99 -11.76 7.54 31.75 7 G/C 0.25 -0.62 3.72 -5.29 -0.87 40.25 8 C/T -0.70 -0.27 3.48 -0.22 -11.00 32.92 9 T/C 0.84 0.25 2.81 10.90 1.04 39.60 10 C/A 0.08 1.06 2.93 9.99 9.91 28.73 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. 0.34 0.30 3.21 4.17 3.92 35.26 s.d. 0.86 0.58 0.47 9.12 6.54 7.31 **************************************************************************** Local strand I base helical parameters step X-disp Y-disp h-Rise Incl. Tip h-Twist 1 G/A -0.14 1.32 2.83 15.11 -16.20 36.01 2 A/G 0.05 -1.34 3.35 12.30 -7.40 34.61 3 G/C -0.13 -0.86 3.14 2.33 -7.05 40.00 4 C/A 0.12 -2.24 3.58 5.37 1.04 49.71 5 A/T -1.87 2.85 1.66 20.14 -39.89 32.05 6 T/G 0.23 -0.79 4.20 13.03 20.31 34.61 7 G/C -0.78 -1.03 3.67 -1.26 7.65 40.59 8 C/T 1.37 1.13 3.40 -18.77 0.38 34.66 9 T/C 0.26 -0.14 2.94 1.50 -15.73 41.02 10 C/A 0.21 1.59 2.99 18.63 -18.77 31.93 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.07 0.05 3.17 6.84 -7.57 37.52 s.d. 0.83 1.59 0.67 11.66 16.52 5.43 **************************************************************************** Local strand II base step parameters step Shift Slide Rise Tilt Roll Twist 1 C/T -0.78 0.62 2.69 -14.29 15.35 31.19 2 T/C 0.49 0.07 3.45 -1.62 -7.15 34.84 3 C/G -0.01 -0.49 3.55 0.83 -2.94 38.50 4 G/T 1.06 0.88 3.74 8.93 3.54 31.63 5 T/A 0.02 -0.55 2.56 -17.62 8.99 27.11 6 A/C -1.87 0.29 3.72 4.18 3.57 49.40 7 C/G -0.68 -0.22 3.15 -3.63 1.93 38.18 8 G/A -1.14 0.45 3.14 -6.45 1.12 36.18 9 A/G 0.18 0.54 3.14 -5.18 0.92 39.21 10 G/T -0.07 0.85 3.39 -4.30 3.63 31.15 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.28 0.24 3.25 -3.91 2.90 35.74 s.d. 0.85 0.52 0.40 7.90 6.12 6.20 **************************************************************************** Local strand II base helical parameters step X-disp Y-disp h-Rise Incl. Tip h-Twist 1 C/T -0.89 -0.51 2.79 25.29 23.54 37.44 2 T/C 1.20 -1.05 3.34 -11.77 2.66 35.58 3 C/G -0.35 0.13 3.57 -4.45 -1.26 38.62 4 G/T 0.83 -0.04 3.95 6.31 -15.94 33.02 5 T/A -2.09 -2.26 1.92 16.66 32.65 33.45 6 A/C 0.05 2.57 3.57 4.26 -4.98 49.68 7 C/G -0.57 0.60 3.18 2.94 5.53 38.39 8 G/A 0.57 0.94 3.30 1.79 10.28 36.74 9 A/G 0.70 -0.85 3.10 1.37 7.68 39.55 10 G/T 0.85 -0.70 3.45 6.70 7.92 31.64 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. 0.03 -0.12 3.22 4.91 6.81 37.41 s.d. 1.01 1.31 0.55 10.28 13.75 5.05 **************************************************************************** xyz coordinates of C1' atoms bp xI yI zI xII yII zII 1 G-C 3.939 37.017 4.965 -3.895 33.285 -1.480 2 A-T -0.654 39.360 6.120 -5.917 31.082 2.746 3 G-C -4.835 38.934 7.608 -4.717 28.295 6.928 4 C-G -8.320 35.928 8.630 -3.000 27.224 11.826 5 A-T -9.743 32.075 11.236 -2.130 29.946 15.954 6 T-A -10.447 29.959 16.105 -2.797 32.220 20.839 7 G-C -9.616 27.262 20.295 -4.244 36.020 23.316 8 C-G -7.864 28.545 25.044 -7.813 39.181 24.208 9 T-A -6.645 31.497 29.036 -12.153 39.817 25.568 10 C-G -7.928 34.840 32.467 -16.753 37.258 26.675 11 A-T -10.726 37.546 35.688 -19.056 34.279 29.741 **************************************************************************** xyz coordinates of RN9/YN1 atoms bp xI yI zI xII yII zII 1 G-C 3.416 35.657 4.928 -3.033 32.493 -0.586 2 A-T -0.346 37.958 6.382 -4.551 31.012 3.298 3 G-C -3.812 38.072 8.192 -3.641 29.106 7.530 4 C-G -7.132 35.993 9.500 -2.650 28.611 12.134 5 A-T -9.210 33.268 11.880 -2.452 31.377 15.962 6 T-A -10.097 31.387 16.102 -3.333 33.397 20.171 7 G-C -9.943 28.650 19.972 -5.424 36.038 22.432 8 C-G -8.959 29.336 24.444 -8.835 38.324 23.609 9 T-A -8.036 31.441 28.538 -12.479 38.407 25.357 10 C-G -8.934 33.875 31.982 -16.247 35.930 27.006 11 A-T -10.972 36.161 35.270 -17.969 33.455 30.313 **************************************************************************** xyz coordinates of RC8/YC6 atoms bp xI yI zI xII yII zII 1 G-C 3.868 34.577 5.649 -3.068 31.127 -0.612 2 A-T 0.572 37.483 7.287 -3.907 29.808 3.483 3 G-C -2.817 38.419 9.074 -2.572 28.522 8.148 4 C-G -6.748 37.149 10.120 -1.567 29.051 12.855 5 A-T -9.616 34.578 11.846 -1.571 32.329 16.433 6 T-A -11.003 32.361 15.738 -2.992 34.728 20.221 7 G-C -11.034 29.102 19.267 -5.840 37.175 21.798 8 C-G -9.990 28.728 23.784 -9.817 38.666 22.710 9 T-A -8.681 30.240 28.331 -13.471 37.884 24.565 10 C-G -8.819 32.537 32.237 -16.782 34.727 26.610 11 A-T -10.352 35.012 35.696 -18.006 32.083 30.184 **************************************************************************** xyz coordinates of O1P atoms w.r.t. the middle frame of each dimer step xI yI zI xII yII zII 1 GA/TC -3.12 10.41 -1.63 -4.35 9.61 -2.68 2 AG/CT -3.93 9.74 -0.33 -3.37 9.73 -0.89 3 GC/GC -3.64 9.80 0.82 -4.17 9.64 -0.83 4 CA/TG -4.91 8.78 -0.50 -3.73 9.68 -0.58 5 AT/AT -6.77 8.06 -2.13 -6.69 8.09 -2.65 6 TG/CA -3.62 9.71 -0.29 -4.79 8.88 -0.85 7 GC/GC -4.17 9.65 -0.60 -3.81 9.81 0.79 8 CT/AG -3.51 9.87 -0.83 -3.94 9.80 0.33 9 TC/GA -4.13 9.54 -1.64 -3.70 9.65 -0.15 10 CA/TG -3.58 9.89 -1.00 -3.93 9.54 -1.04 **************************************************************************** xyz coordinates of O1P atoms w.r.t. the middle helix frame of each dimer step xIH yIH zIH xIIH yIIH zIIH 1 GA/TC -3.69 10.68 2.19 -4.86 9.62 0.47 2 AG/CT -3.30 8.58 -0.45 -2.78 10.90 -0.75 3 GC/GC -3.90 9.46 0.41 -4.44 9.98 -0.70 4 CA/TG -4.37 7.32 -0.23 -3.24 11.17 0.57 5 AT/AT -9.69 8.53 1.33 -9.65 8.09 1.39 6 TG/CA -3.27 11.10 1.17 -4.42 7.50 -0.25 7 GC/GC -4.82 9.46 -0.01 -4.50 9.99 0.50 8 CT/AG -2.76 10.66 -1.84 -3.02 8.76 -1.36 9 TC/GA -3.57 9.14 -1.71 -3.25 10.08 0.31 10 CA/TG -3.08 10.44 0.77 -3.42 8.99 1.35 **************************************************************************** xyz coordinates of O2P atoms w.r.t. the middle frame of each dimer step xI yI zI xII yII zII 1 GA/TC -1.53 9.42 0.12 -2.56 9.08 -0.92 2 AG/CT -1.64 9.31 0.74 -1.42 8.55 0.29 3 GC/GC -1.45 8.58 1.39 -2.13 9.03 0.60 4 CA/TG -2.65 8.39 0.65 -2.18 8.44 1.03 5 AT/AT -4.70 9.10 -1.03 -4.72 8.83 -1.19 6 TG/CA -1.88 8.54 1.18 -2.57 8.44 0.37 7 GC/GC -2.15 9.05 0.86 -1.63 8.67 1.53 8 CT/AG -1.55 8.81 0.44 -1.61 9.11 1.15 9 TC/GA -1.91 9.31 -0.36 -1.95 9.05 1.64 10 CA/TG -1.34 9.08 -0.03 -1.48 10.25 -0.72 **************************************************************************** xyz coordinates of O2P atoms w.r.t. the middle helix frame of each dimer step xIH yIH zIH xIIH yIIH zIIH 1 GA/TC -2.00 9.17 3.41 -3.18 8.51 2.06 2 AG/CT -1.05 8.14 0.70 -0.79 9.71 0.36 3 GC/GC -1.76 8.24 1.15 -2.31 9.40 0.60 4 CA/TG -2.23 6.83 1.09 -1.54 9.81 1.92 5 AT/AT -7.67 8.97 2.86 -7.62 8.13 2.95 6 TG/CA -1.41 9.78 2.33 -2.33 6.91 1.11 7 GC/GC -2.65 8.85 1.21 -2.41 8.85 1.46 8 CT/AG -0.69 9.77 -0.61 -0.78 8.19 -0.24 9 TC/GA -1.44 8.89 -0.30 -1.39 9.45 1.96 10 CA/TG -0.93 9.42 1.75 -0.95 9.63 1.59 **************************************************************************** xyz coordinates of P atoms w.r.t. the middle frame of each dimer step xI yI zI xII yII zII 1 GA/TC -2.53 9.23 -0.96 -3.54 8.61 -1.93 2 AG/CT -2.76 8.85 -0.11 -2.51 8.53 -0.73 3 GC/GC -2.73 8.64 0.64 -3.07 8.70 -0.51 4 CA/TG -3.68 7.96 -0.33 -3.24 8.40 -0.01 5 AT/AT -5.45 7.90 -1.48 -5.48 7.75 -1.86 6 TG/CA -3.03 8.46 0.23 -3.61 8.02 -0.61 7 GC/GC -3.05 8.73 -0.28 -2.88 8.66 0.73 8 CT/AG -2.60 8.72 -0.61 -2.85 8.80 0.38 9 TC/GA -2.97 8.71 -1.21 -2.69 8.71 0.40 10 CA/TG -2.67 8.78 -0.64 -2.50 9.18 -0.86 **************************************************************************** xyz coordinates of P atoms w.r.t. the middle helix frame of each dimer step xIH yIH zIH xIIH yIIH zIIH 1 GA/TC -3.07 9.35 2.39 -4.09 8.43 0.89 2 AG/CT -2.14 7.68 -0.19 -1.91 9.70 -0.62 3 GC/GC -2.99 8.29 0.32 -3.31 9.05 -0.43 4 CA/TG -3.17 6.49 -0.01 -2.69 9.85 0.99 5 AT/AT -8.39 8.10 1.90 -8.42 7.45 1.91 6 TG/CA -2.63 9.80 1.49 -3.27 6.61 -0.01 7 GC/GC -3.67 8.54 0.17 -3.57 8.84 0.52 8 CT/AG -1.83 9.55 -1.54 -1.94 7.78 -1.07 9 TC/GA -2.45 8.30 -1.22 -2.21 9.13 0.77 10 CA/TG -2.19 9.26 0.98 -1.99 8.60 1.32 **************************************************************************** xyz coordinates of P atoms bp xI yI zI xII yII zII 1 G-C 7.027 34.329 4.560 -8.765 31.117 -0.322 2 A-T 4.781 40.800 6.774 -6.322 26.425 3.848 3 G-C -1.815 42.874 7.314 -3.221 24.132 9.213 4 C-G -8.191 40.705 8.004 0.123 26.498 15.082 5 A-T -12.088 34.978 8.217 -0.277 28.809 21.267 6 T-A -12.340 28.767 10.738 -0.423 35.144 23.779 7 G-C -12.756 26.564 16.982 -4.310 40.832 23.954 8 C-G -9.412 24.230 22.950 -10.680 43.196 24.288 9 T-A -6.081 26.719 28.115 -16.768 40.823 24.424 10 C-G -3.935 31.775 32.003 -21.533 35.733 26.477 11 A-T -5.956 36.816 35.464 -23.443 30.466 29.921 ******************************************************************************************* Phosphorus-phosphorus distance in Angstroms 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 C T C G T A C G A G T 1 G 16.8 15.5 15.2 14.8 19.1 20.6 23.4 28.0 31.7 36.0 39.8 2 A 18.1 18.4 18.6 17.2 19.5 18.7 19.4 23.5 27.9 33.3 37.9 3 G 15.6 17.4 18.9 18.2 19.9 18.2 16.9 19.2 22.8 28.4 33.7 4 C 12.7 15.0 17.3 17.9 19.5 18.4 16.4 16.7 18.5 23.3 28.6 5 A 9.9 11.2 14.0 16.4 18.7 19.4 18.5 18.1 17.9 20.6 24.9 6 T 11.9 9.4 10.3 13.4 16.0 18.8 19.6 19.9 18.8 19.5 22.2 7 G 18.3 14.6 12.5 13.0 13.4 16.5 18.0 18.3 16.6 15.9 17.2 8 C 24.3 19.5 15.1 12.6 10.4 14.2 17.4 19.1 18.2 17.1 16.9 9 T 28.9 24.3 19.3 14.4 9.2 11.0 14.8 17.5 18.1 18.0 17.9 10 C 32.7 28.8 24.0 18.2 11.7 9.6 12.1 15.3 17.4 18.9 19.7 11 A 36.3 33.3 29.3 23.6 17.3 13.0 12.3 13.7 16.0 18.0 19.4 **************************************************************************** Strand I helix radius step P O4' C1' 1 G/A 10.9 7.7 7.1 2 A/G 8.1 5.2 4.7 3 G/C 8.3 5.7 5.2 4 C/A 6.9 4.5 3.9 5 A/T 12.9 9.6 9.2 6 T/G 7.9 5.6 4.7 7 G/C 8.6 6.1 5.5 8 C/T 9.6 6.4 6.3 9 T/C 9.1 5.9 5.7 10 C/A 10.6 7.7 7.2 **************************************************************************** Strand II helix radius step P O4' C1' 1 C/T 10.3 7.2 6.7 2 T/C 9.6 6.6 6.4 3 C/G 9.2 6.5 6.0 4 G/T 8.8 6.2 5.5 5 T/A 12.5 9.2 8.8 6 A/C 6.6 4.3 3.7 7 C/G 8.8 6.2 5.7 8 G/A 8.3 5.1 4.8 9 A/G 9.7 7.1 6.5 10 G/T 10.0 7.1 6.3 **************************************************************************************** Base-pair helix axis Ox Oy Oz Xx Xy Xz Yx Yy Yz Zx Zy Zz 1 GA/TC 0.01 32.27 2.79 0.15 -0.92 0.35 0.90 0.28 0.34 -0.41 0.27 0.87 -1.16 33.04 5.29 0.64 -0.60 0.48 0.65 0.76 0.07 -0.41 0.27 0.87 2 AG/CT -1.17 35.06 5.23 0.70 -0.60 0.39 0.47 0.79 0.38 -0.54 -0.08 0.84 -2.98 34.80 8.05 0.84 -0.04 0.54 -0.01 1.00 0.09 -0.54 -0.08 0.84 3 GC/GC -2.24 33.92 8.45 0.86 -0.04 0.51 -0.02 0.99 0.10 -0.51 -0.10 0.85 -3.96 33.59 11.32 0.65 0.60 0.46 -0.56 0.79 -0.24 -0.51 -0.10 0.85 4 CA/TG -5.05 34.11 10.55 0.67 0.60 0.44 -0.50 0.80 -0.33 -0.55 0.00 0.84 -7.16 34.12 13.76 0.18 0.98 0.12 -0.82 0.22 -0.54 -0.55 0.00 0.84 5 AT/AT -5.12 37.16 15.44 0.16 0.97 0.17 -0.55 0.23 -0.80 -0.82 0.03 0.57 -6.83 37.22 16.64 -0.12 0.97 -0.23 -0.56 -0.26 -0.79 -0.82 0.03 0.57 6 TG/CA -5.32 34.25 17.97 -0.20 0.97 -0.11 -0.80 -0.23 -0.55 -0.56 -0.02 0.83 -7.60 34.17 21.33 -0.68 0.59 -0.44 -0.48 -0.81 -0.35 -0.56 -0.02 0.83 7 GC/GC -9.11 33.35 20.32 -0.68 0.59 -0.43 -0.54 -0.80 -0.25 -0.49 0.06 0.87 -10.83 33.55 23.32 -0.87 -0.05 -0.49 0.02 -1.00 0.08 -0.49 0.06 0.87 8 CT/AG -9.40 34.82 23.89 -0.86 -0.04 -0.51 -0.07 -0.98 0.20 -0.51 0.21 0.84 -11.11 35.53 26.70 -0.74 -0.60 -0.30 0.44 -0.77 0.46 -0.51 0.21 0.84 9 TC/GA -10.79 34.12 27.25 -0.65 -0.62 -0.44 0.53 -0.79 0.32 -0.55 -0.02 0.84 -12.44 34.05 29.79 -0.17 -0.98 -0.13 0.82 -0.21 0.53 -0.55 -0.02 0.84 10 CA/TG -13.31 34.30 29.37 -0.16 -0.97 -0.16 0.91 -0.21 0.36 -0.38 -0.09 0.92 -14.55 34.02 32.40 0.33 -0.94 0.05 0.86 0.32 0.38 -0.38 -0.09 0.92 **************************************************************************************** Strand I helix axis Ox Oy Oz Xx Xy Xz Yx Yy Yz Zx Zy Zz 1 G/A -0.89 32.46 2.20 0.28 -0.95 0.12 0.88 0.30 0.38 -0.40 -0.00 0.92 -2.01 32.45 4.79 0.74 -0.60 0.32 0.55 0.80 0.24 -0.40 -0.00 0.92 2 A/G -0.71 34.69 5.42 0.66 -0.60 0.45 0.53 0.80 0.29 -0.53 0.05 0.85 -2.48 34.86 8.25 0.85 -0.04 0.53 0.06 1.00 -0.02 -0.53 0.05 0.85 3 G/C -2.45 34.38 8.48 0.84 -0.03 0.54 -0.04 0.99 0.12 -0.54 -0.12 0.83 -4.14 33.99 11.10 0.62 0.61 0.49 -0.57 0.78 -0.25 -0.54 -0.12 0.83 4 C/A -4.99 34.94 10.53 0.54 0.59 0.60 -0.54 0.79 -0.29 -0.65 -0.17 0.74 -7.31 34.35 13.19 -0.06 0.98 0.17 -0.76 0.06 -0.65 -0.65 -0.17 0.74 5 A/T -3.18 35.97 16.38 0.42 0.85 -0.32 -0.58 -0.02 -0.81 -0.70 0.53 0.48 -4.34 36.85 17.19 0.05 0.71 -0.70 -0.71 -0.47 -0.52 -0.70 0.53 0.48 6 T/G -7.02 33.73 16.62 -0.44 0.89 0.15 -0.82 -0.33 -0.46 -0.36 -0.33 0.87 -8.54 32.35 20.28 -0.83 0.54 -0.14 -0.43 -0.77 -0.47 -0.36 -0.33 0.87 7 G/C -9.52 32.72 20.10 -0.73 0.60 -0.33 -0.54 -0.80 -0.25 -0.42 -0.00 0.91 -11.04 32.70 23.44 -0.91 -0.07 -0.41 0.07 -1.00 0.03 -0.42 -0.00 0.91 8 C/T -9.13 34.96 24.14 -0.85 -0.07 -0.53 -0.10 -0.96 0.28 -0.52 0.29 0.80 -10.90 35.94 26.87 -0.75 -0.60 -0.27 0.40 -0.75 0.53 -0.52 0.29 0.80 9 T/C -11.23 34.32 27.26 -0.62 -0.58 -0.52 0.56 -0.80 0.22 -0.54 -0.16 0.82 -12.83 33.86 29.68 -0.10 -0.96 -0.25 0.83 -0.22 0.51 -0.54 -0.16 0.82 10 C/A -14.46 34.14 29.23 -0.11 -0.94 -0.31 0.95 -0.20 0.24 -0.29 -0.27 0.92 -15.32 33.33 31.98 0.41 -0.90 -0.14 0.87 0.33 0.37 -0.29 -0.27 0.92 **************************************************************************************** Strand II helix axis Ox Oy Oz Xx Xy Xz Yx Yy Yz Zx Zy Zz 1 C/T 0.80 32.29 3.39 0.02 -0.83 0.56 0.92 0.24 0.32 -0.40 0.51 0.76 -0.32 33.70 5.52 0.57 -0.51 0.64 0.72 0.69 -0.09 -0.40 0.51 0.76 2 T/C -1.61 35.34 5.09 0.72 -0.61 0.33 0.43 0.77 0.47 -0.54 -0.20 0.82 -3.42 34.67 7.83 0.84 -0.05 0.54 -0.07 0.98 0.20 -0.54 -0.20 0.82 3 C/G -2.03 33.44 8.43 0.87 -0.05 0.48 0.00 1.00 0.09 -0.49 -0.08 0.87 -3.77 33.16 11.54 0.69 0.59 0.43 -0.54 0.81 -0.23 -0.49 -0.08 0.87 4 G/T -4.77 32.64 11.17 0.80 0.56 0.21 -0.45 0.80 -0.39 -0.39 0.22 0.89 -6.30 33.52 14.71 0.43 0.90 -0.04 -0.82 0.37 -0.44 -0.39 0.22 0.89 5 T/A -7.50 36.89 14.76 -0.01 0.77 0.64 -0.69 0.45 -0.56 -0.72 -0.45 0.53 -8.89 36.02 15.77 -0.39 0.89 0.22 -0.57 -0.04 -0.82 -0.72 -0.45 0.53 6 A/C -4.93 34.48 18.92 0.07 0.97 -0.22 -0.72 -0.11 -0.68 -0.69 0.20 0.70 -7.37 35.21 21.41 -0.51 0.55 -0.66 -0.52 -0.81 -0.27 -0.69 0.20 0.70 7 C/G -8.76 33.97 20.54 -0.62 0.58 -0.52 -0.54 -0.80 -0.26 -0.57 0.12 0.81 -10.57 34.35 23.13 -0.82 -0.04 -0.57 -0.03 -0.99 0.12 -0.57 0.12 0.81 8 G/A -9.59 34.72 23.68 -0.87 -0.03 -0.50 -0.05 -0.99 0.14 -0.50 0.14 0.86 -11.24 35.19 26.50 -0.72 -0.61 -0.32 0.48 -0.78 0.41 -0.50 0.14 0.86 9 A/G -10.30 33.88 27.31 -0.70 -0.62 -0.36 0.48 -0.78 0.41 -0.53 0.12 0.84 -11.96 34.25 29.90 -0.24 -0.97 -0.01 0.81 -0.20 0.55 -0.53 0.12 0.84 10 G/T -12.02 34.43 29.76 -0.23 -0.97 -0.00 0.86 -0.21 0.47 -0.46 0.10 0.88 -13.59 34.79 32.80 0.25 -0.94 0.24 0.85 0.33 0.40 -0.46 0.10 0.88